Bahagian Koordinasi Dan Program Khas telah ditubuhkan pada 1 Julai 2018.  Bahagian ini terletak di blok 1, aras 1 Kompleks Darulnaim.   Bahagian Koordinasi dan Program Khas dipangku oleh Seorang Ketua Penolong Pengarah Gred dan dibantu oleh 7 orang Ketua Penolong Pengarah Gred N48, seorang Penolong Pengarah Gred N52 dan 9 orang kakitangan Gred N17/N19. Bahagian ini terdiri daripada 8 Bahagian Utama iaitu Bahagian Pelaburan/Pemantauan Projek, Bahagian Sosial dan Ekonomi,Bahagian Ihthirafi, Bahagian Bajet & Analisa , Bahagian Perundangan, Bahagian Perundangan II, Bahagian Pembangunan dan Bahagian Pembangunan Tanah.

VISI

Kearah Bahagian Koordinasi dan Program Khas yang cemerlang menjelang 2020

MISI

Membantu dan menyelaras setiap jabatan  dalam mencapai wawasan negeri Kelantan. 

• Penubuhan Bahagian ini adalah untuk memantau setiap Tonggak dalam Pelan Strategik Kelantan Melangkah Ke Hadapan 2016 – 2025 iaitu Tonggak Keberkatan, Tonggak Kemakmuran, dan Tonggak Kebajikan.

• Untuk menggerakkan secara sistematik, proaktif dan kompetitif jabatan dan agensi-agensi negeri dalam mencapai wawasan negeri.